Differences

This shows you the differences between two versions of the page.

Link to this comparison view

Both sides previous revision Previous revision
Next revision
Previous revision
interactome:experiments:20191210 [2019/12/10 11:27]
dan
interactome:experiments:20191210 [2019/12/10 11:38] (current)
dan
Line 4: Line 4:
  
 == Re-trying with new cDNA sample. == == Re-trying with new cDNA sample. ==
- 
-##​Overview ​ 
-^ Step   ^ Description ​                                    ​^ ​ Date/​Initials ​  ^ Link protocol ​ ^ Link results ​ ^ 
-| 1      | Total RNA extraction from HEK293T cells         ​| ​ 20191122DEY ​    ​| ​               |               | 
-| 2      | 1st strand cDNA synthesis ​                      ​| ​ 20191122DEY ​    ​| ​               |               | 
-| **3**  | **Target gene amplification from cDNA sample** ​ | Current ​ |                |               | 
-| 4      | BP-reaction ​                                    ​| ​                 |                |               | 
-| 5      | Sanger sequence check                           ​| ​                 |                |               | 
- 
  
 #### Material #### Material
- 
-Before preparing: Check your primer Tm at NEB website (http://​tmcalculator.neb.com/#​!/​main with Phusion/HF buffer setting) 
-\\ 
-\\ 
-\\ 
-\\ 
 \\ \\
 #### Protocol #### Protocol
Line 33: Line 18:
 ^  Frd primer ​          ​| ​ PI 11    |  PI 11    |  PI 13   ​| ​ PI 13   ​| ​ PI 15   ​| ​ PI 15   ​| ​ PI 17  |  PI 17  |  PI 19     ​| ​ PI 19     | ^  Frd primer ​          ​| ​ PI 11    |  PI 11    |  PI 13   ​| ​ PI 13   ​| ​ PI 15   ​| ​ PI 15   ​| ​ PI 17  |  PI 17  |  PI 19     ​| ​ PI 19     |
 ^  Rvs Primer ​          ​| ​ PI 12    |  PI 12    |  PI 14   ​| ​ PI 14   ​| ​ PI 16   ​| ​ PI 16   ​| ​ PI 18  |  PI 18  |  PI 20     ​| ​ PI 20     | ^  Rvs Primer ​          ​| ​ PI 12    |  PI 12    |  PI 14   ​| ​ PI 14   ​| ​ PI 16   ​| ​ PI 16   ​| ​ PI 18  |  PI 18  |  PI 20     ​| ​ PI 20     |
- +|  Tm                   ​| ​ 56       ​| ​ 56       ​| ​ 58      |  58      |  65      |  65      |  56     ​| ​ 56     ​| ​ 57        |  57        |
- +
- +
 \\ \\
 \\ \\
-\\ 
-\\ 
- 
- 
-\\ 
-\\ 
-\\ 
-\\ 
-\\ 
- 
- 
  
   *Mix the following reagents in one tube (ideally from top to bottom)   *Mix the following reagents in one tube (ideally from top to bottom)
Line 81: Line 52:
 \\ \\
 \\ \\
- --- //​[[daney@sfc.keio.ac.jp|Dan Yamamoto-Evans]] 2019/11/25 14:48//+ --- //​[[daney@sfc.keio.ac.jp|Dan Yamamoto-Evans]] 2019/12/10 11:37//
 **Print at 96%** **Print at 96%**
  • interactome/experiments/20191210.1575944877.txt.gz
  • Last modified: 2019/12/10 11:27
  • by dan