Nozomu Yachie, Ph.D.
谷内江 望
Professor
Director of Research
The University of British Columbia
School of Biomedical Engineering (SBME)
Faculty of Applied Science and Faculty of Medicine
Specially Appointed Professor
Osaka University
Premium Research Institute for Human Metaverse Medicine (PRIMe)
Visiting Professor
The University of Tokyo
Research Center for Advanced Science and Technology (RCAST)
Canada Research Chair (Tier 2) in Synthetic Biology
Allen Distinguished Investigator
CIFAR Fellow in Multiscale Human
E-mail: nozomu.yachieubc.ca
ブリティッシュコロンビア大学 教授 / Director of Research
School of Biomedical Engineering (SBME)
Faculty of Applied Science and Faculty of Medicine
大阪大学 特任教授
ヒューマン・メタバース疾患研究拠点 (PRIMe)
東京大学 客員教授
先端科学技術研究センター
Canada Research Chair (Tier 2) in Synthetic Biology
Allen Distinguished Investigator
CIFAR Fellow in Multiscale Human
E-mail: nozomu.yachieubc.ca
Materials for talk invitation
講演用事前資料
Usual materials for talk invitation can be found here.
講演用の事前資料をこちらに準備しています。
Bio
Nozomu Yachie is a Professor and Director of Research at the School of Biomedical Engineering (SBME) at the University of British Columbia (UBC) and a Specially Appointed Professor at the Premium Research Institute for Human Metaverse Medicine (PRIMe) at Osaka University. Combining technologies in cell engineering, genome editing, and computational biology, the Yachie laboratory at UBC and Osaka University is developing new technologies to measure the dynamics of molecules and cells in complex biological systems, including mammalian development and cell differentiation.
From 2014-2020, Yachie was an Associate Professor at the University of Tokyo’s Research Center for Advanced Science and Technology (RCAST) and also served as the Director of the Laboratories for Systems Biology and Medicine (LSBM).
Yachie received his PhD degree in Systems Biology from Keio University in 2009. He then completed postdoctoral training at Dr. Fritz Roth’s lab at Harvard Medical School before receiving a Banting Postdoctoral Fellowship and continuing his training with Dr. Roth at the University of Toronto.
谷内江はブリティッシュコロンビア大学 (University of British Columbia, UBC) School of Biomedical Engineering (SBME)と大阪大学ヒューマン・メタバース疾患研究拠点 (PRIMe)で哺乳動物合成生物学の研究グループを主宰しています。
2009年に慶應大学において生命情報科学の分野で学位取得後、ハーバード大学のFritz Roth研究室で博士研究員として合成生物学の研究を始めました。2010年にRoth博士の異動に伴ってカナダのトロント大学に移り、2012年からはカナダ政府のBanting Fellowでした。2014年7月から東京大学先端科学技術研究センターで最初の研究室を主宰し(現在は客員教授)、その後2020年9月からUBCに移り、2023年3月からは大阪大学でも研究室をスタートしました。
UBCおよび大阪大学の谷内江研究室では細胞工学、遺伝子工学、生命情報科学を組み合わせて哺乳動物の発生を含む複雑な多細胞システムにおける分子と細胞のダイナミクスを理解するための新技術を開発しています。
Selected Awards
September 2024
The 14th Nagase Grand Prize
The Frontier Salon Foundation
2024年9月
永瀬賞 最優秀賞
フロンティアサロン財団
March 2024
JSPS Prize
Japan Society for the Promotion of Science (JSPS)
2024年3月
日本学術振興会賞
日本学術振興会 (JSPS)
April 2023-Today
CIFAR Fellow
MacMillan Multiscale Human Program
Canadian Institute for Advanced Research
2023年4月-現在
CIFAR Fellow
MacMillan Multiscale Human Program
Canadian Institute for Advanced Research
February 2022-Today
Allen Distinguished Investigator
Allen Institute
2022年2月-現在
Allen Distinguished Investigator
Allen Institute
September 2020-Today
Canada Research Chair in Synthetic Biology
The Canadian Institutes of Health Research (CIHR)
2022年2月-現在
Canada Research Chair in Synthetic Biology
The Canadian Institutes of Health Research (CIHR)
April 2020
Minister's Young Scientists Award
Ministry of Education, Culture, Sports, Science and Technology, Japan
2020年4月
文部科学大臣賞若手科学者賞
October 2014-March 2018
PRESTO Researcher
Japan Science and Technology (JST)
2014年10月-2018年3月
さきがけ研究者
科学技術振興機構 (JST)
April 2012-March 2014
Banting Fellowship
National Sciences and Engineering Research Council of Canada (NSERC)
2012年4月-2014年3月
Banting Fellowship
National Sciences and Engineering Research Council of Canada (NSERC)
($140,000/2年間, カナダ全土より第8位で受賞)
April 2007-March 2012
JSPS Fellowships ('DC1', 'PD' and 'Research Abroad')
Japan Society for the Promotion of Science (JSPS)
2007年4月-2012年3月
特別研究員DC1→PD→海外特別研究員
日本学術振興会 (JSPS)
Academic Appointments
職歴
September 2020-Today
The University of British Columbia
(July 2023-Today)
Professor
School of Biomedical Engineering (SBME)
(July 2022-Today)
Research Director
School of Biomedical Engineering (SBME)
(September 2020-June 2023)
Associate Professor
School of Biomedical Engineering (SBME)
2020年9月-現在
The University of British Columbia
(2023年7月-現在)
Professor
School of Biomedical Engineering (SBME)
(2022年7月-現在)
Research Director
School of Biomedical Engineering (SBME)
(2020年9月-2023年6月)
Associate Professor
School of Biomedical Engineering (SBME)
March 2023-Today
Osaka University
Specially Appointed Professor
Premium Research Institute for Human Metaverse Medicine (PRIMe)
2023年3月-現在
大阪大学
特任教授
ヒューマン・メタバース疾患研究拠点 (PRIMe)
September 2020-Today
The University of Tokyo
(October 2023-Today)
Visiting Professor
(September 2020-August 2023)
Visiting Associate Professor
Research Center for Advanced Science and Technology (RCAST)
2020年9月-現在
東京大学
(2023年10月-現在)
客員教授
先端科学技術研究センター (RCAST)
(2020年9月-2023年8月)
客員准教授
先端科学技術研究センター (RCAST)
April 2023-March 2024
Keio University
Guest Professor (Global)
Graduate School of Media and Governance
2023年4月-2024年3月
慶應義塾大学
特別招聘教授 (国際)
政策・メディア研究科
July 2014-August 2020
The University of Tokyo
Associate Professor
Synthetic Biology Division
Research Center for Advanced Science and Technology (RCAST)
Graduate School of Engineering
Department of Advanced Interdisciplinary Studies (AIS)
(April 2015-August 2020)
Graduate School of Science
Department of Biological Sciences
(April 2015-August 2020)
PEAK Program, Graduate School of Arts and Sciences
GPES Program, Graduate School of Arts and Sciences
(January 2018-October 2019)
Director
Laboratories for Systems Biology and Medicine
2014年7月-2020年8月
東京大学
准教授
合成生物学分野
先端科学技術研究センター (RCAST)
工学系研究科先端学際工学専攻
(2015年4月-2020年8月)
理学系研究科生物科学専攻
(2018年4月-2020年8月)
総合文化研究科PEAK
総合文化研究科GPES
(2018年1月-2019年10月)
ディレクター
システム生物医学研究室群
June 2014-December 2021
Keio University
(April 2015-December 2021)
Adjunct Associate Professor
Graduate School of Media and Governance
Institute for Advanced Biosciences
(June 2014-March 2015)
Adjunct Assistant Professor
Graduate School of Media and Governance
Institute for Advanced Biosciences
2014年6月-2021年12月
慶應義塾大学
(2015年4月-2021年12月)
特任准教授
政策・メディア研究科
先端生命科学研究所
(2014年6月-2015年3月)
特任講師
政策・メディア研究科
先端生命科学研究所
October 2014-March 2018
Japan Science and Technology
PRESTO Researcher
2014年10月-2018年3月
科学技術振興機構
さきがけ研究者
April 2010-June 2014
Harvard Medical School and University of Toronto
(December 2010-June 2014)
Postdoctoral Fellow (w/ Dr. Fritz Roth)
Donnelly Centre for Cellular and Biomolecular Research
University of Toronto
(April 2010-November 2010)
Postdoctoral Fellow (w/ Dr. Fritz Roth)
Department of Biological Chemistry and Molecular Pharmacology
Harvard Medical School
2010年4月-2014年6月
Harvard Medical School and University of Toronto
(2010年12月-2014年6月)
Postdoctoral Fellow (w/ Dr. Fritz Roth)
Donnelly Centre for Cellular and Biomolecular Research
University of Toronto
(2010年4月-2010年11月)
Postdoctoral Fellow (w/ Dr. Fritz Roth)
Department of Biological Chemistry and Molecular Pharmacology
Harvard Medical School
April 2009-March 2010
Keio University
Postdoctoral Fellow
Institute for Advanced Biosciences
2009年4月-2010年3月
慶應義塾大学
博士研究員
先端生命科学研究所
Education
学歴
March 2009
Ph.D., Systems Biology Program, Keio University
2009年3月
博士 (学術), システム生物学プログラム, 慶應義塾大学SFC
March 2007
M.M.G., Bioinformatics Program, Keio University
2007年3月
修士 (政・メ), バイオインフォマティクスプログラム, 慶應義塾大学SFC
March 2005
B.A., Faculty of Environment and Information Studies, Keio University
2005年3月
学士 (環境情報学), 環境情報学部, 慶應義塾大学SFC
Other Positions
その他の職
May 2019-Today
Japan Science and Technology Agency (JST)
PRESTO Advisor
2019年5月-現在
科学技術振興機構
さきがけ「多細胞」アドバイザー
CREST「バイオDX」アドバイザー
March 2017-Today
Science Council of Japan
Adjunct member
Young Academy of Japan
2017年3月-現在
日本学術会議
連携会員
September 2020-December 2020
Creative Destrcution Lab
Scientist
2020年9月-2020年12月
Creative Destrcution Lab
Scientist
April 2019-August 2021
Synplogen
Scientific Advisor
2019年4月-2021年8月
シンプロジェン
サイエンティフィックアドバイザー
November 2015-October 2020
Robotic Biology Institute, Inc.
Advisor
2015年11月-2020年10月
ロボティックス・バイオロジー・インスティテュート
技術顧問
November 2017-March 2020
RIKEN
Visiting Reseacher
2017年11月-2020年3月
理化学研究所
客員研究員
July 2014-March 2019
Spiber, Inc.
(October 2016-March 2019)
Fellow
(July 2014-September 2016)
Advisor
2014年7月-2019年3月
Spiber株式会社
(2016年10月-2019年3月)
フェロー
(2014年7月-2016年9月)
アドバイザー
March 2018-March 2019
New Energy and Industrial Technology Development Organization (NEDO)
NEDO Committee Member
2018年3月-2019年3月
新エネルギー・産業技術総合開発機構
NEDO技術委員
January 2018-December 2018
Robotic Biology Consortium
Chairman
2018年1月-2018年12月
ロボティック・バイオロジー・コンソーシアム
会長
May 2016-November 2018
NARA Institute of Science and Technology
Part-time Lecturer
2016年5月-2018年11月
奈良先端科学技術大学大学院大学
非常勤講師
July 2016-June 2018
United Japanese Researchers Around the World (UJA)
Board Member
2016年7月-2018年6月
海外日本人研究者ネットワーク
理事
October 2012-March 2016
Mie University
Part-time Lecturer
Department of Medicine
2012年10月-2016年3月
三重大学医学部
非常勤講師
April 2006-March 2010
Keio University
(April 2009-March 2010)
Visiting Senior Researcher
Keio Research Institute at SFC
(April 2007-March 2009)
Part-time Lecturer
Department of Environmental Information
(April 2006-March 2009)
Research Assistant (TTCK Fellow)
Institute for Advanced Biosciences
2006年4月-2010年3月
慶應義塾大学
(2009年4月-2010年3月)
上席所員 (訪問)
慶應SFC研究所
(2007年4月-2009年3月)
非常勤講師
環境情報学部
(2006年4月-2009年3月)
研究助手 (TTCKフェローシップ)
先端生命科学研究所
Full CV
Yachie's CV is here.
より詳しいCV (英語版) はこちら。
Materials for talk invitation
講演用資料
Short biosketch
略歴
Nozomu Yachie is a Professor and Director of Research at UBC Biomedical Engineering and at Osaka University’s Premium Research Institute for Human Metaverse Medicine (PRIMe). Combining technologies in cell engineering, genome editing, and computational biology, the Yachie laboratories are developing new technologies to measure the dynamics of molecules and cells in complex biological systems, including mammalian development and cell differentiation. After completing his postdoctoral training at Fritz Roth’s laboratory at Harvard and the University of Toronto, Yachie was an Associate Professor at the University of Tokyo’s Research Center for Advanced Science and Technology (RCAST) from 2014 to 2020. He is a recipient of several awards, including Banting Fellow (2012), JST PRESTO Researcher (2014), Canada Research Chair (2020), Minister’s Prize by Ministry of Science and Education (2022), Allen Distinguished Investigator Award (2022), JSPS Prize (2024) and the Nagase Prize (2024).
谷内江はブリティッシュコロンビア大学UBC Biomedical Engineeringの教授およびResearch Directorで大阪大学ヒューマン・メタバース疾患研究拠点の特任教授です。哺乳動物合成生物学の研究プログラムを展開しています。慶應大学において生命情報科学の分野で学位取得後、ハーバード大学およびトロント大学のFritz Roth研究室で博士研究員として合成生物学の研究を始めました。2014年7月から東京大学先端科学技術研究センターで最初の研究室を主宰し(現在は客員教授)、その後2020年9月からUBCに移り、2023年3月から大阪大学にも研究室を構えました。受賞に日本学術振興会賞 (2024)、永瀬賞 (2024)、Allen Distinguished Investigator Award (2022) 、文部科学大臣若手科学者賞 (2022)、Canada Research Chair (2020)、JSTさきがけ (2014)、Banting Fellow (2012)などがあります。
Updated Usual Lecture Abstract
講演用アブストラクト
Technologies for "look-back-in-time" biology
Biological studies often require the destruction of samples to observe molecular and cellular details, hindering the understanding of dynamic processes. To overcome this issue and observe the dynamics of living systems in high resolution, my group is developing two approaches: (1) a video camera system and (2) a “time-reversing” system to observe dynamic molecular and cellular events. In the first system, which we call “DNA event recording,” molecular and cellular events within a multicellular organism are progressively stored in synthetic “DNA tapes” embedded in the cells’ genomes. We are currently working toward obtaining the first high-resolution whole-body developmental map of the mouse. In the second system, called “retrospective clone isolation,” cells can be isolated and analyzed after identifying their future states. Cells in a population are first tagged with unique, short DNA barcodes and propagated. A subpopulation is then subjected to a specific assay. Identifying the barcode of a clone of interest after an assay, the same clone is isolated in a barcode-dependent manner from the initial population before it expresses the target phenotype. I will share our current progress in these ideas.
細胞は分裂し、ゲノム情報を娘細胞に伝え、機能を動的に変化させて多様な組織構造を形成します。受精卵から始まる発生過程では、細胞外部からのシグナルが内部シグナルに変換されて遺伝子発現パターンを変化させ、細胞の状態を遷移させます。さらに、そのように変化する細胞はさらに他の細胞の環境へのシグナルを生み出すので、一連の反応が複雑に繰り返される中で、多数の細胞が異なる空間領域で機能的なクラスターへと自己組織化します。しかしながら、分子・細部レベルでの観察は生物試料の破壊を必要とするので、この複雑で美しいダイナミクスを観察する決定的な方法はまだありません。これまでに、私達の研究グループは「DNAイベントレコーディング」と「遡及的クローン単離」という二つの技術開発を進めてきました。DNAイベントレコーディングは、生命システムで起こる分子および細胞イベントが人工のDNAテープに時間経過と共に記録されていくビデオカメラのようなシステムを細胞内に構築しようというアイディアです。多数の細胞それぞれが経験した過去の動的な細胞分裂系譜や遺伝子発現プロファイルの変化を1細胞ゲノミクス技術で一斉に読み出し、計算機で再構成しようとしています。遡及的クローン単離では、集団内の細胞を一つひとつ短いDNAバーコードでタグ付けし、これをわずかに増殖させます。その後、これを二つのサブグループに分け、一方を特定のアッセイに使用すると、時間が経過した後、特定の表現型を示す細胞クローンが認めらることがあります。このような場合において、もう一方の初期に保存されたサブグループから同じバーコードを持つ細胞クローンを単離し、「将来特定の運命を持つようになる細胞」がどのような初期状態にあるのかを調べることなどができます。これらの新技術開発における私たちの最新の状況を共有します。